Научная деятельность академии регламентируется Федеральным законом от 29 декабря 2012 года № 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации» и подзаконными актами, а также Уставом академии.
Ежегодно утверждается план научно-исследовательской работы для академии и её филиалов.